Le Bureau de direction du Carrefour compte cinq postes occupés par les personnes suivantes :
- un directeur général qui assure la présidence du Carrefour;
- trois directeurs des études dont un représente les collèges anglophones;
- un directeur des affaires étudiantes et communautaires.
La directrice des affaires éducatives et de la recherche de la Fédération des cégeps ainsi que la coordonnatrice du Carrefour font également partie du Bureau de direction.
Pour l’année scolaire 2018-2019, sa composition est la suivante :
 | Michelle Comtois Directrice générale Cégep Saint-Jean-sur-Richelieu Présidente du Bureau de direction |
 | Isabelle Laurent Directrice des affaires éducatives |
 | Lyne Boileau Coordonnatrice |
 | Annie-Claude Banville Directrice des études |
 | Carole Lavallée Directrice des études |
 | Caroline Roy Directrice des services aux étudiants |
 | Jocelynn Meadows Directrice des études |
 | Francine Bouchard Directrice de la formation continue et des services aux entreprises |